Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP3Q9NS15 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTBP3Q9NS15 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LTBP3Q9NS15 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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