Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD2Q9NRG4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms