Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLE3Q9NRF9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLE3Q9NRF9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms