Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO6Q9NRD1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO6Q9NRD1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms