Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ASCL3Q9NQ33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASCL3Q9NQ33 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms