Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNMB3Q9NPA1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms