Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf88Q9H8K7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf88Q9H8K7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms