Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NRDE2Q9H7Z3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRDE2Q9H7Z3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 548.3 ms