Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIPK3Q9H422 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIPK3Q9H422 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIPK3Q9H422 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIPK3Q9H422 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIPK3Q9H422 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK3Q9H422 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK3Q9H422 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK3Q9H422 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIPK3Q9H422 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms