Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG9Q9H0W8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMG9Q9H0W8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMG9Q9H0W8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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