Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL4Q9C0H6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL4Q9C0H6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms