Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM4Q9C037 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms