Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NLRP1Q9C000 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NLRP1Q9C000 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NLRP1Q9C000 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms