Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM3Q9BZQ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM3Q9BZQ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms