Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPF3BQ9BZI7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UPF3BQ9BZI7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms