Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GABARAPL3Q9BY60 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms