Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC46A2Q9BY10 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC46A2Q9BY10 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC46A2Q9BY10 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms