Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRRTQ9BXP5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRTQ9BXP5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRTQ9BXP5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms