Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF7Q9BWX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF7Q9BWX1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms