Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FNDC11Q9BVV2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FNDC11Q9BVV2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms