Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM43Q9BTV4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM43Q9BTV4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM43Q9BTV4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM43Q9BTV4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM43Q9BTV4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM43Q9BTV4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM43Q9BTV4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM43Q9BTV4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM43Q9BTV4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms