Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBGCP2Q9BSJ2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBGCP2Q9BSJ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms