Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms