Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UTP23Q9BRU9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP23Q9BRU9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP23Q9BRU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP23Q9BRU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP23Q9BRU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP23Q9BRU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms