Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RIOK1Q9BRS2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RIOK1Q9BRS2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms