Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TXNDC17Q9BRA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TXNDC17Q9BRA2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms