Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms