Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD9AQ99638 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD9AQ99638 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAD9AQ99638 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms