Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD1Q99460 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD1Q99460 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD1Q99460 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms