Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPR78Q96P69 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPR78Q96P69 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms