Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCLT1Q96NL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCLT1Q96NL6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms