Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NSMCE2Q96MF7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NSMCE2Q96MF7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms