Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRC1Q96M27 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRC1Q96M27 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms