Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms