Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM47Q96LD4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM47Q96LD4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms