Protein–RNA interactions for Protein: Q96L14

CEP170P1, Cep170-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170P1Q96L14 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170P1Q96L14 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170P1Q96L14 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms