Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKNOX2Q96KN3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms