Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRIG1Q96JA1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG1Q96JA1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG1Q96JA1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms