Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SHDQ96IW2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SHDQ96IW2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms