Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAX2Q96IS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAX2Q96IS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms