Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUCLG2Q96I99 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SUCLG2Q96I99 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SUCLG2Q96I99 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms