Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNF8Q96H20 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNF8Q96H20 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNF8Q96H20 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNF8Q96H20 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNF8Q96H20 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNF8Q96H20 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNF8Q96H20 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNF8Q96H20 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms