Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
L3HYPDHQ96EM0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
L3HYPDHQ96EM0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms