Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEURL3Q96EH8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEURL3Q96EH8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms