Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF0

MTMR8, Myotubularin-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR8Q96EF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR8Q96EF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTMR8Q96EF0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR8Q96EF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms