Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RUNDC1Q96C34 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUNDC1Q96C34 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUNDC1Q96C34 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms