Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYAP1Q96A49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYAP1Q96A49 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms