Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC102AQ96A19 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms