Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRIM63Q969Q1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TRIM63Q969Q1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM63Q969Q1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TRIM63Q969Q1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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TRIM63Q969Q1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TRIM63Q969Q1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRIM63Q969Q1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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