Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAMP4Q969E2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAMP4Q969E2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms